密云菌肥是從自然界中采集到的固氮活性菌種，經科學配方、組合加工研制而成的一種無公害新型復合生物肥。密云菌肥在施用過程中，須注意以下要點：

1、對含硫高的土壤和銹水田，不宜施用生物菌肥，因為硫能殺死生物菌。

2、根據土壤情況施用菌肥的更佳溫度是25℃～27℃，低于5℃、高于45℃，施用效果較差。同時還應掌握固氮菌適宜的土壤濕度為60%左右，即見干見濕的土壤濕度最為適宜。

3、不能和其他農藥混用。為防止活菌致死，注意不要與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑和含硫化肥，如硫酸鉀等以及稻草灰混合用，因為這些藥、肥很容易殺死生物菌。

在施用時，若施菌肥與防病蟲、除草相矛盾時，可先施菌肥，隔48小時后，再打藥除草。若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。同時還應防止與未腐熟的農家肥混用，因為農家肥在腐熟的過程中會發酵，這樣會直接殺死生物菌。

4、與化肥混用要注意化肥用量不能過大。高濃度的化學物質對菌肥里的微生物有毒害作用，尤其注意不能與碳酸氫銨等堿性肥料和硝酸鈉等生理堿性肥料混用。